Università degli Studi di Perugia

• Biochimica veterinaria sistematica e comparata
• Biologia Molecolare

Oral exam

Come da Calendario degli esami approvato per l'AA 2012/13

Introduzione- Cenni storici: scoperta del DNA, Genomica, Trascrittomica e Proteomica
Struttura degli acidi nucleici- Struttura dei nucleotidi, basi azotate: comuni e meno rappresentate, forme tautomeriche, modificazioni non enzimatiche dei nucleotidi. Stuttura acidi nucleici: legame fosfodiestere e scheletro covalente di DNA E RNA. struttura tridimensionale del Dna, stutture insolite. Superavvolgimento del DNA, nucleosoma, ruolo degli istoni, eterocromatina ed eucromatina. Denaturazione e rinaturazione delle eliche, effetto ipercromico, Tm. Strutture e ruoli dell'RNA: mRNA, tRNA, rRNA miRNA, siRNA. Il genoma e le sequenze non codifivcanti.
Replicazione del DNA- la replicazione semiconservativa, la chimica della sintesi del DNA, proteine coinvolte nella fase di inizio e di progressione della duplicazione; le DNA polimerasi: caratteristiche, meccanismo d'azione, proof reading. DNA ligasi. La trascrittasi inversa.
Sistemi di Riparazione del DNA
Trascrizione del DNA-il promotore. RNA polimerasi di procarioti e degli eucarioti. differenze strutturali e funzionali. Fase di inizio, allungamento e terminazione della trascrizione. Le modificazioni post-trascrizionali dell'RNA: capping, le code di poli(A). Splicing: chimica dello splicing, snRPN, splicesoma. Splicing alternativo. Editing. Maturazione del tRNA. i Riboenzimi.
Sintesi proteica - Il codice genetico: la decifrazione e le sue caratteristiche. ORF. L'RNA transfer: struttura tridimensionale. Aminoacil-tRNA sintetasi e Attivazione degli amminoacidi, rilettura e correzione; interazioni codon-anticodon. I ribosomi: composizione, struttura. Fase d'inizio di allungamento e di terminazione della traduzione. ruolo dei fattori proteici . Modificazioni post traduzionali.
Regolazione dell'espressione genica - struttura di un gene, promotore, sequenze upstream , attivatori e repressori operon del lattosio, enhancers, fattori di trascrizione. Differenza tra eucarioti e procarioti. Modificazione dell'inerazione istone DNA: metilazione e demetilazione, acetilazioe e deacetilazione degli istoni. Interazione fattori di trascrizione e DNA. Modificazioni conformazionali e strutturali dei fattori di trascrizione e segnali cellulari. Ormoni steroidei e regolazione dell'espressione genica. Regolazione post trascrizionale: stabilità e emivita dell'mRNA. ruolo dei miRNA e dei siRNA. mRNA e Responsive element, es controllo della Traduzione degli mRNA dela ferritina e trasferrina.
Estrazione acidi nucleici - scelta del protocollo, principali componenti di un tampone di estrazione per RNA e DNA. estrazione Dna genomico,DNA plasmidico e mRMA. Utilizzo di kit. Valutazione qualitativa e quantitativa dell'estratto analisi elettroforetica e spettrofotometrica.
Sequenziamento del DNA - principi teorici del sequenzialmeto di Sanger. Descrizione della metodica. Sistemi autiomatizzati.
DNA ricombinante - endonucleasi di restrizione, vettori di clonaggio e di espressione. Trasferimento del DNA ricombinante nella cellula ospite, Isolamento dei geni clonati. Marcatori di selezione.
PCR: principi e fasi - Caratteristiche delle DNA polimerasi termostabili e dei primer. disegno di un primer. RT-PCR one e two step, PCR quantitativa: utilizzo di sonde fluorescenti, esempi di possibili applicazioni in Medicina Veterinaria.
Fingerprinting - principi, descrizione delle fasi della metodic, , utilizzo di sonde.
Microarray - principi, descrizione delle fasi della metodica, esempi di utilizzo .
Cenni sulle metodologie proteomiche - elettroforesi bidimensionale, sequenziamento e banche dati, western blotting.
Lezioni pratiche - estrazione DNA da linfociti, elettroforesi e valutazione quantitativa dell'estratto. Disegno di un Primer e utilizzo banche dati

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Lezioni teoriche ed esercitazoni pratiche

Dai geni ai genomi. Dale - von Schantz.
EdiSES Edizioni Scientifiche ed Universitarie
Edizione: II / 2008

David L Nelson, Michael M Cox
I principi di biochimica di Lehninger
Quinta edizione-2010
ZANICHELLI

James D Watson, Tania A Baker, Stephen P Bell, Alexander Gann, Michael Levine, Richard Losick
Biologia molecolare del gene
Sesta edizione- 2009
Zanichelli.

Lo studente dovrà dimostrare di aver acquisito un'adeguata preparazione di base per la comprensione delle funzioni biologiche a livello molecolare delle macromolecole informazionali e per l'utilizzo delle principali metodiche di biologia molecolare

come da orario delle lezioni

come da orario delle lezioni

tutorato studenti per chiarimenti e approfondimenti
martedi 16-17
mercioledì 16-17

Almeno il 75% delle lezioni

Aula Barboni - POLO Didattico - Facoltà di Medicina Veterinaria- via San costanzo, 4 -Perugia