Insegnamento AAF-SOFTWARE TOOLS FOR GENETIC IMPROVEMENT
| Nome del corso di laurea | Economia e cultura dell'alimentazione |
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| Codice insegnamento | A002815 |
| Curriculum | Comune a tutti i curricula |
| Docente responsabile | Camillo Pieramati |
| Docenti |
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| Ore |
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| CFU | 3 |
| Regolamento | Coorte 2020 |
| Erogato | Erogato nel 2022/23 |
| Erogato altro regolamento | |
| Attività | A scelta dello studente |
| Ambito | A scelta dello studente |
| Settore | NN |
| Anno | 2 |
| Periodo | Secondo Semestre |
| Tipo insegnamento | Opzionale (Optional) |
| Tipo attività | Attività formativa monodisciplinare |
| Lingua insegnamento | Inglese |
| Contenuti | Prima parte - genetica di popolazione: dataset di microsatelliti; simulazione di un dataset; strumenti di genetica di popolazione. Seconda parte - genetica quantitativa: simulare un pedigree ed un dataset di caratteri quantitativi; stima di indici genetici ed accuratezze. Terza parte - genomica: le basi dell'ambiente *nix; simulare, trattare ed analizzare sequenze genetiche e dati genotipici ad alta densità. |
| Testi di riferimento | Materiali didattici forniti dai docenti iin UniStudium |
| Obiettivi formativi | Introdurre lo studente all'utilizzo dei software utilizzati nel miglioramento genetico |
| Prerequisiti | BIOMETRIA ZOOTECNICA + MIGLIORAMENTO GENETICO (LM SZ), MIGLIORAMENTO GENETICO AVANZATO (LM BAA) |
| Metodi didattici | Attività pratica in aula informatica con esecuzione di attività guidate con software free |
| Altre informazioni | Attività svolta in collaborazione con altri docenti (F.M. Sarti, S. Capomaccio e G. Marconi) |
| Modalità di verifica dell'apprendimento | Esecuzione di esercizi al personal computer |
| Programma esteso | Principali software utilizzati: "R", Arlequin, Structure, BLUPF90, plink |