Insegnamento AAF-I SOFTWARE DEDICATI AL MIGLIORAMENTO GENETICO
| Nome del corso di laurea | Economia e cultura dell'alimentazione |
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| Codice insegnamento | A001316 |
| Curriculum | Comune a tutti i curricula |
| Docente responsabile | Camillo Pieramati |
| Docenti |
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| Ore |
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| CFU | 3 |
| Regolamento | Coorte 2019 |
| Erogato | Erogato nel 2019/20 |
| Erogato altro regolamento | |
| Attività | A scelta dello studente |
| Ambito | A scelta dello studente |
| Settore | NN |
| Anno | 2 |
| Periodo | Secondo Semestre |
| Tipo insegnamento | Opzionale (Optional) |
| Tipo attività | Attività formativa monodisciplinare |
| Lingua insegnamento | Italiano |
| Contenuti | Uso di software scientifico libero per gli studi di genetica di popolazione, per la valutazione genetica di caratteri quantitativi, per le analisi genomiche. |
| Testi di riferimento | Nessun testo di riferimento. Tutto il materiale didattico è fornito dal docente e disponibile in UniStudium. |
| Obiettivi formativi | Essere in grado di trattare dati genetici in diversi formati e di eseguire ed interpretare semplici analisi di genetica di popolazione, valutazioni genetiche e genomiche. |
| Prerequisiti | Una buona conoscenza sia delle tecnologie informatiche sia del miglioramento genetico |
| Metodi didattici | Tutte le attività didattiche si svolgono in aula informatica. Dopo una breve introduzione teorica, lo studente replica passo passo sulla propria postazione l'esercizio illustrato dal docente. |
| Altre informazioni | Frequenza obbligatoria |
| Modalità di verifica dell'apprendimento | Al termine di ogni lezione ad ogni studente è assegnato un semplice compito da svolgere e consegnare in UniStudium prima della lezione successiva. Al termine del corso colloquio orale. |
| Programma esteso | Simulazione e analisi di dati di genetica di popolazione (microsatelliti): frequenze alleliche, equilibrio di Hardy-Weinberg, F(IT)-F(IS)-F(ST), distanze genetiche, analisi multivariate, rappresentazioni grafiche. Simulazione e analisi di caratteri quantititivi corrrelati: il pedigree, il modello genetico, i parametri genetici (ereditabilità, ripetibilità e correlazioni), stima di EBV e r(TI). Simulazione e analisi di dati genomici (DNA chips). La bash di Linux; gestione dei dati e controlli di qualità; esplorazione dei dati; GWAS. |