Insegnamento PROGETTAZIONE RAZIONALE DEI FARMACI
| Nome del corso di laurea | Biotecnologie farmaceutiche |
|---|---|
| Codice insegnamento | A001969 |
| Sede | PERUGIA |
| Curriculum | Comune a tutti i curricula |
| Docente responsabile | Maria Letizia Barreca |
| Docenti |
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| Ore |
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| CFU | 6 |
| Regolamento | Coorte 2021 |
| Erogato | Erogato nel 2022/23 |
| Erogato altro regolamento | Informazioni sull'attività didattica |
| Attività | Caratterizzante |
| Ambito | Discipline farmaceutiche |
| Settore | CHIM/08 |
| Anno | 2 |
| Periodo | Primo Semestre |
| Tipo insegnamento | Obbligatorio (Required) |
| Tipo attività | Attività formativa monodisciplinare |
| Lingua insegnamento | ITALIANO |
| Contenuti | CADD (computer-aided drug discovery): comprensione ed applicazione delle principali metodologie computazionali applicate alla progettazione/scoperta di piccole molecole organiche di interesse farmaceutico. |
| Testi di riferimento | Chimica Farmaceutica, A. Gasco, F. Gualtieri, C. Melchiorre - CEA Nessun testo disponibile soddisfa pienamente le esigenze del corso. Il materiale necessario allo studio verrà fornito dal docente del corso |
| Obiettivi formativi | L'insegnamento ha l'obiettivo principale di fornire conoscenze sia teoriche che pratiche sulle principali metodologie computazionali applicate alla progettazione/scoperta di piccole molecole organiche di interesse farmaceutico. Le principali conoscenze acquisite saranno: - conoscenze relative all'analisi di strutture cristallografiche e dell'interazione ligando-proteina - conoscenze relative ai principali approcci computazionali per l'identificazione/sviluppo di composti di interesse farmaceutico - conoscenze relative alle principali problematiche relative alla scoperta razionale di un farmaco - conoscenze di base sull'utilizzo di alcuni softwares di modellistica molecolare Le principali abilità (ossia la capacità di applicare le conoscenze acquisite) saranno: - saper utilizzare (utente principiante) alcuni programmi di modellistica molecolare - saper analizzare strutture tridimensionali - saper analizzare e identificare interazioni ligando-proteina - saper comprendere un progetto di structure-based drug discovery |
| Prerequisiti | Lo studente che accede a questo insegnamento deve essere in possesso di una buona preparazione nei fondamenti della chimica organica e della biochimica. E' inoltre necessario aver frequentato il corso di "Chimica Farmaceutica avanzata". |
| Metodi didattici | Il corso è organizzato nel seguente modo: - lezioni in aula su tutti gli argomenti del corso: utilizzo di slides che verrano consegnate agli studenti in formato elettronico alla fine del corso; - esercitazioni presso il Laboratorio di Bioinformatica: gli studenti effettueranno 12 esercitazioni guidate a posto singolo della durata di quattro ore ciascuna. Ogni esercitazione sarà preceduta da una spiegazione accurata del lavoro da effettuare e dalla consegna di materiale in forma cartacea che illustra dettagliatamente l'esercitazione. Durante tutta la durata dell'esercitazione vi è interazione continua tra docente-studente (domande, chiarimenti, ulteriori spiegazioni). |
| Altre informazioni | SEDE: Laboratorio di Bioinformatica (Via del Giochetto - PAD. A ) |
| Modalità di verifica dell'apprendimento | Prove di laboratorio in itinere: valutazione delle conoscenze man mano acquisite. L'esame prevede solo una prova orale finale, che consiste in una discussone relativa agli argomenti trattati durante il corso ed indicati nel programma. L'esame è finalizzato ad accertare la conoscenza e comprensione da parte dello studente dei moderni approcci computazionali applicati alla progettazione razionale di piccole molecole organiche di interesse farmaceutico. Verrà inoltre valutata la capacità di sintesi, esposizione e proprietà di linguaggio che lo studente possiede. La durata dell'esame varia a seconda dell'andamento della prova stessa (durata media di circa 30 min). Per informazioni sui servizi di supporto agli studenti con disabilità e/o DSA visita la pagina http://www.unipg.it/disabilita-e-dsa |
| Programma esteso | - Introduzione alla Modellistica Molecolare - Banche dati strutturali e visualizzazione di strutture molecolari - Costruzione di piccole molecole organiche: Maestro - Minimizzazione dell'energia e Force Fields - Analisi conformazionale - CADD (computer-aided drug discovery): approcci target-based e ligand-based ¿ - Modelli farmacoforici (LigandScout) - Progettazione razionale di composti di interesse farmaceutico - Docking molecolare: LigPrep e Glide - SiteMap ed ottimizzazione degli hit compounds ¿ - Virtual screening di librerie di composti (fragment-based, composti commercialmente disponibili e drug repositioning) - Predizione delle principali proprietà chimico-fisiche e di ADME - PyMol |