Insegnamento BIOCHIMICA VETERINARIA E BIOLOGIA MOLECOLARE
- Corso
- Medicina veterinaria
- Codice insegnamento
- GP005362
- Curriculum
- Comune a tutti i curricula
- Docente
- Elisabetta Chiaradia
- CFU
- 5
- Regolamento
- Coorte 2017
- Erogato
- 2017/18
- Tipo insegnamento
- Obbligatorio (Required)
- Tipo attività
- Attività formativa integrata
BIOCHIMICA VETERINARIA SISTEMATICA E COMPARATA
| Codice | GP005392 |
|---|---|
| CFU | 2 |
| Docente | Elisabetta Chiaradia |
| Docenti |
|
| Ore |
|
| Attività | Base |
| Ambito | Discipline della struttura, funzione e metabolismo delle molecole di interesse biologico |
| Settore | BIO/10 |
| Tipo insegnamento | Obbligatorio (Required) |
| Lingua insegnamento | Italiano |
| Contenuti | Introduzione: overview sulle principali vie metaboliche e loro integrazione. Similitudini e specializzazioni metaboliche dei diversi tessuti: Biochimica dei processi digestivi nelle specie monogastriche. Biochimica dei processi digestivi nelle specie poligastriche Biosintesi del lattosio, funzione della lattoalbumina |
| Testi di riferimento | Nelson DL, Cox MM - Principi di Biochimica. Zanichelli, Bologna. A.P. Mariani, A. Podestà - Biochimica e Biotecnologia del Rumine - Piccin. |
| Obiettivi formativi | L'obiettivo del corso è fornire agli studenti le basi per poter comprendere le specailizzazioni metaboliche dei diversi distretti dell'organismo e le principali differenze metaboliche che sussistono tra le diverse specie animali in modo da poter meglio comprendere le diverse esigenze nutrizionali e la gestione delle patologie in maniera specie-specifica. Lo studente dovrà aver acquisito conoscenze sulle diversità metaboliche di cellule, tessuti e organi delle principali specie animali; interpretare da un punto di vista biochimico la nutrizione e l'adattamento metabolico delle principali specie animali Lo studente dovrà dimostare di avere acquisito un background teorico pratico e la manualità per poter lavorare in laboratorio con campioni biologici e poter eseguire di un test biochimico per il dosaggo di metaboliti. |
| Metodi didattici | Il corso è organizzato nel seguente modo: Lezioni frontali in aula su tutti gli argomenti del corso Esercitazioni in laboratorio su dosaggio di metaboliti marker di vie metaboliche- Gli studenti saranno divisi in quattro gruppi ( massimo 20 studenti) |
| Programma esteso | Presentazione del corso e overview sulle principali vie metaboliche con richiami di biochimica generale. Descrizioni delle principali specializzaione metaboliche dei diversi tessuti e organi. ( 1 ora e 30 minuti) Introduzioni alla biochimismo dei processi digestivi nelle diverse specie animali. Digestione carboidrati e lipidi nelle specie monogastriche. (2 ore) Lipoproteine:struttura sintesi e ruolo. Digestione proteine dei monogastrici, ruolo e specificità dell proteasi Assorbimento degli amminoacidi e overview sul loro destino metabolico. (2 ore) . Introduzione al metabolismo ruminare. Caratteristiche strutturali dei polissacaridi vegetali; cellulosa, emicellulosa, sostanze pectiche. Fase idrolitica della digestione ruminale dei carboidrati (1 ora e 30 minuti) Fase ossidativa dell digestione ruminale dei glucidi: glicolisi anaerobia, via di Entner-Doudoroff , via fosfochetolasica, via del pentoso fosfato (3 ore) Fase riduttiva del metabolismo glucidico ruminale-Destino dell’acido piruvico: produzione di acetato, propionato, butirrato, lattato, formiato, metano e H2 (3 ore) Bioidrogenazione: reazioni e significato. (1 ora) Metabolismo dei composti azotati nelle specie poligastriche - Vie di escrezione dell'azoto, sintesi acido Urico (2 ore) Lezione Pratica: dosaggio di metboliti /o enzimi markers di vie metaboliche |
BIOLOGIA MOLECOLARE
| Codice | GP005393 |
|---|---|
| CFU | 3 |
| Docente | Elisabetta Chiaradia |
| Docenti |
|
| Ore |
|
| Attività | Base |
| Ambito | Discipline della struttura, funzione e metabolismo delle molecole di interesse biologico |
| Settore | BIO/11 |
| Tipo insegnamento | Obbligatorio (Required) |
| Lingua insegnamento | Italiano |
| Contenuti | Introduzione, Struttura degli acidi nucleici, Replicazione del DNA, ,Riparazione del DNA, Trascrizione del DNA e sua regolazione, Sintesi proteica, Estrazione acidi nucleici, Sequenziamento del DNA, DNA ricombinante, PCR, Fingerprinting, Microarray, Cenni di metodologie proteomiche. |
| Testi di riferimento | Dai geni ai genomi. Dale - von Schantz. EdiSES Edizioni Scientifiche ed Universitarie Edizione: II / 2008 David L Nelson, Michael M Cox I principi di biochimica di Lehninger Quinta edizione-2010 ZANICHELLI oppure James D Watson, Tania A Baker, Stephen P Bell, Alexander Gann, Michael Levine, Richard Losick Biologia molecolare del gene Sesta edizione- 2009 Zanichelli. |
| Obiettivi formativi | Lo studenente dovrà dimostare di aver acquisito conoscenza dei meccanismi molecolari di base per la trasmissione dell’informazione genetica, la sua espressione e regolazione; Dovrà inoltre dimostare di aver compreso i principi teorico pratici delle principali metodologie applicate allo studio di DNA, RNA e Proteine. Durante le lezioni pratiche lo studente dovrà dimostare di avere acquisito un background teorico pratico e la manualità necessaria per poter lavorare in laboratorio con campioni biologici e con acidi nucleici |
| Metodi didattici | Il corso è organizzato nel seguente modo: Lezioni frontali in aula su tutti gli argomenti del corso Esercitazioni in laboratorio: esecuzione di un esperimento di estrazione di acidi nucleici- elettroforesi di DNA Esercitazione in aula informatica per l'utilizzo di database . Per le esercitazioni gli studenti saranno divisi in quattro gruppi ( massimo 20 studenti) |
| Programma esteso | Introduzione al corso- Cenni storici. Le scienze OMICHE: genomica, trascrittomica e proteomica (1 ora). Struttura degli acidi nucleici- nucleotidi, basi azotate. Legame fosfodiestere e scheletro covalente di DNA E RNA. Superavvolgimento del DNA, nucleosoma, ruolo degli istoni. Temperatura di melting. Strutture e ruoli dell'RNA. Il genoma e le sequenze non codificanti (2 ore). Replicazione del DNA: La replicazione semiconservativa, le proteine coinvolte nelle duplicazione, sintesi della catena lenta, le DNA polimerasi, elicasi e ligasi. La trascrittasi inversa. Sistemi di controllo della duplicazione. Sistemi di riparazione del DNA (2 ore). Trascrizione del DNA: Definizione di gene e sua struttura. RNA polimerasi di procarioti e degli eucarioti: differenze strutturali e funzionali. Fase di inizio, allungamento e terminazione della trascrizione. (2 ore). Le modificazioni post-trascrizionali dell'RNA: capping, le code di poli(A). Splicing, Editing. Maturazione del tRNA. Regolazione post trascrizionale: stabilità e emivita dell'mRNA, ruolo dei miRNA e dei siRNA. Struttura RNA maturo, sequenze UTR (2 ore).. Sintesi proteica - Il codice genetico: la decifrazione e le sue caratteristiche. L'RNA transfer: struttura tridimensionale. Aminoacil-tRNA sintetasi e Attivazione degli amminoacidi, interazioni codon-anticodon. I ribosomi: composizione, struttura. Fase d'inizio di allungamento e di terminazione della traduzione. ruolo dei fattori proteici . Modificazioni post traduzionali. (2 ore). Regolazione dell'espressione genica-. Differenza tra eucarioti e procarioti. Promotore, sequenze upstream, attivatori e repressori. Operon del lattosio e del triptofano. Fattori di trascrizione, enhancers Interazione fattori di trascrizione e DNA. Modificazioni conformazionali e strutturali dei fattori di trascrizione e segnali cellulari. Ormoni steroidei e regolazione dell'espressione genica. mRNA e responsive element. (2 ore). Estrazione acidi nucleici. concetto di resa e purezza, composizione tampone di estrazione. Strategie di estrazione e kit commerciali, valutazione quantità dell’estratto. (2 ore). Elettroforesi: principi e applicazioni per lo studio degli acid nucleici. (1 ora). PCR: Principi. Le tre fasi: temperature, tempi, peculiarità. Primer: caratteristiche, utilizzo software online per disegno (cenni). qPCR: principi e sonde. (2 ore). Sequenziamento del Dna- Sequenziamento di Sanger, Strategie NGS, e sequenziamento di terza generazione - Fingerprinting: Enzimi di restrizione. fasi di esecuzione e applicazioni (2 ore) Microarray: principi e applicazioni ( 30 mins)- Cenni di Clonaggio (1 ora) Proteomica: cenni, SDSPAGE, elettroforesi bidimensionale, immunoblotting. (2.5 ore) Data base: alcuni esempi (2 ore) Lezione pratica: Estrazione di acidi nucleici da linfociti di diverse specie animali- Elettroforesi del DNA estratto e misura spettrofotometrica della sua concentrazione. Come disegrare un primer ( 4 ore) |