Insegnamento AAF-SOFTWARE TOOLS FOR GENETIC IMPROVEMENT

Corso
Economia e cultura dell'alimentazione
Codice insegnamento
A002815
Curriculum
Comune a tutti i curricula
Docente
Camillo Pieramati
Docenti
  • Camillo Pieramati
Ore
  • 30 ore - Camillo Pieramati
CFU
3
Regolamento
Coorte 2020
Erogato
2022/23
Attività
A scelta dello studente
Ambito
A scelta dello studente
Settore
NN
Tipo insegnamento
Opzionale (Optional)
Tipo attività
Attività formativa monodisciplinare
Lingua insegnamento
Inglese
Contenuti
Prima parte - genetica di popolazione: dataset di microsatelliti; simulazione di un dataset; strumenti di genetica di popolazione.
Seconda parte - genetica quantitativa: simulare un pedigree ed un dataset di caratteri quantitativi; stima di indici genetici ed accuratezze.
Terza parte - genomica: le basi dell'ambiente *nix; simulare, trattare ed analizzare sequenze genetiche e dati genotipici ad alta densità.
Testi di riferimento
Materiali didattici forniti dai docenti iin UniStudium
Obiettivi formativi
Introdurre lo studente all'utilizzo dei software utilizzati nel miglioramento genetico
Prerequisiti
BIOMETRIA ZOOTECNICA + MIGLIORAMENTO GENETICO (LM SZ), MIGLIORAMENTO GENETICO AVANZATO (LM BAA)
Metodi didattici
Attività pratica in aula informatica con esecuzione di attività guidate con software free
Altre informazioni
Attività svolta in collaborazione con altri docenti (F.M. Sarti, S. Capomaccio e G. Marconi)
Modalità di verifica dell'apprendimento
Esecuzione di esercizi al personal computer
Programma esteso
Principali software utilizzati: "R", Arlequin, Structure, BLUPF90, plink
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