Insegnamento AAF-SOFTWARE TOOLS FOR GENETIC IMPROVEMENT
- Corso
- Economia e cultura dell'alimentazione
- Codice insegnamento
- A002815
- Curriculum
- Comune a tutti i curricula
- Docente
- Camillo Pieramati
- Docenti
-
- Camillo Pieramati
- Ore
- 30 ore - Camillo Pieramati
- CFU
- 3
- Regolamento
- Coorte 2020
- Erogato
- 2022/23
- Attività
- A scelta dello studente
- Ambito
- A scelta dello studente
- Settore
- NN
- Tipo insegnamento
- Opzionale (Optional)
- Tipo attività
- Attività formativa monodisciplinare
- Lingua insegnamento
- Inglese
- Contenuti
- Prima parte - genetica di popolazione: dataset di microsatelliti; simulazione di un dataset; strumenti di genetica di popolazione.
Seconda parte - genetica quantitativa: simulare un pedigree ed un dataset di caratteri quantitativi; stima di indici genetici ed accuratezze.
Terza parte - genomica: le basi dell'ambiente *nix; simulare, trattare ed analizzare sequenze genetiche e dati genotipici ad alta densità. - Testi di riferimento
- Materiali didattici forniti dai docenti iin UniStudium
- Obiettivi formativi
- Introdurre lo studente all'utilizzo dei software utilizzati nel miglioramento genetico
- Prerequisiti
- BIOMETRIA ZOOTECNICA + MIGLIORAMENTO GENETICO (LM SZ), MIGLIORAMENTO GENETICO AVANZATO (LM BAA)
- Metodi didattici
- Attività pratica in aula informatica con esecuzione di attività guidate con software free
- Altre informazioni
- Attività svolta in collaborazione con altri docenti (F.M. Sarti, S. Capomaccio e G. Marconi)
- Modalità di verifica dell'apprendimento
- Esecuzione di esercizi al personal computer
- Programma esteso
- Principali software utilizzati: "R", Arlequin, Structure, BLUPF90, plink