Insegnamento PROGETTAZIONE RAZIONALE DEI FARMACI
- Corso
- Biotecnologie farmaceutiche
- Codice insegnamento
- A001969
- Sede
- PERUGIA
- Curriculum
- Comune a tutti i curricula
- Docente
- Maria Letizia Barreca
- Docenti
-
- Maria Letizia Barreca
- Andrea Astolfi
- Ore
- 62 ore - Maria Letizia Barreca
- 4 ore - Andrea Astolfi
- CFU
- 6
- Regolamento
- Coorte 2022
- Erogato
- 2023/24
- Attività
- Caratterizzante
- Ambito
- Discipline farmaceutiche
- Settore
- CHIM/08
- Tipo insegnamento
- Obbligatorio (Required)
- Tipo attività
- Attività formativa monodisciplinare
- Lingua insegnamento
- ITALIANO
- Contenuti
- CADD (computer-aided drug discovery): comprensione ed applicazione
delle principali metodologie computazionali applicate alla
progettazione/scoperta di piccole molecole organiche di interesse
farmaceutico. - Testi di riferimento
- Chimica Farmaceutica, A. Gasco, F. Gualtieri, C. Melchiorre - CEA
Nessun testo disponibile soddisfa pienamente le esigenze del corso. Il materiale necessario allo studio verrà fornito dal docente del corso - Obiettivi formativi
- L'insegnamento ha l'obiettivo principale di fornire conoscenze sia
teoriche che pratiche sulle principali metodologie computazionali
applicate alla progettazione/scoperta di piccole molecole organiche di
interesse farmaceutico.
Le principali conoscenze acquisite saranno:
- conoscenze relative all'analisi di strutture cristallografiche e
dell'interazione ligando-proteina
- conoscenze relative ai principali approcci computazionali per
l'identificazione/sviluppo di composti di interesse farmaceutico
- conoscenze relative alle principali problematiche relative alla scoperta
razionale di un farmaco
- conoscenze di base sull'utilizzo di alcuni softwares di modellistica
molecolare
Le principali abilità (ossia la capacità di applicare le conoscenze
acquisite) saranno:
- saper utilizzare (utente principiante) alcuni programmi di modellistica
molecolare
- saper analizzare strutture tridimensionali
- saper analizzare e identificare interazioni ligando-proteina
- saper comprendere un progetto di structure-based drug discovery - Prerequisiti
- Lo studente che accede a questo insegnamento deve essere in possesso di una buona preparazione nei fondamenti della chimica organica e della biochimica. E' inoltre necessario aver frequentato il corso di "Chimica Farmaceutica avanzata".
- Metodi didattici
- Il corso è organizzato nel seguente modo:
- lezioni in aula su tutti gli argomenti del corso: utilizzo di slides che verrano consegnate agli studenti in formato elettronico alla fine del corso;
- esercitazioni presso il Laboratorio di Bioinformatica: gli studenti effettueranno 12 esercitazioni guidate a posto singolo della durata di quattro ore ciascuna. Ogni esercitazione sarà preceduta da una spiegazione accurata del lavoro da effettuare e dalla consegna di materiale in forma cartacea che illustra dettagliatamente l'esercitazione. Durante tutta la durata dell'esercitazione vi è interazione continua tra docente-studente (domande, chiarimenti, ulteriori spiegazioni). - Altre informazioni
- SEDE: Laboratorio di Bioinformatica (Via del Giochetto - PAD. A )
- Modalità di verifica dell'apprendimento
- Prove di laboratorio in itinere: valutazione delle conoscenze man mano acquisite.
L'esame prevede solo una prova orale finale, che consiste in una discussone relativa agli argomenti trattati durante il corso ed indicati nel programma. L'esame è finalizzato ad accertare la conoscenza e comprensione da parte dello studente dei moderni approcci computazionali applicati alla progettazione razionale di piccole molecole organiche di interesse farmaceutico. Verrà inoltre valutata la capacità di sintesi, esposizione e proprietà di linguaggio che lo studente possiede.
La durata dell'esame varia a seconda dell'andamento della prova stessa (durata media di circa 30 min).
Per informazioni sui servizi di supporto agli studenti con disabilità e/o DSA visita la pagina http://www.unipg.it/disabilita-e-dsa - Programma esteso
- - Introduzione alla Modellistica Molecolare
- Banche dati strutturali e visualizzazione di strutture molecolari
- Costruzione di piccole molecole organiche: Maestro
- Minimizzazione dell'energia e Force Fields
- Analisi conformazionale
- CADD (computer-aided drug discovery): approcci target-based e ligand-based ¿
- Modelli farmacoforici (LigandScout)
- Progettazione razionale di composti di interesse farmaceutico
- Docking molecolare: LigPrep e Glide
- SiteMap ed ottimizzazione degli hit compounds ¿
- Virtual screening di librerie di composti (fragment-based, composti commercialmente disponibili e drug repositioning)
- Predizione delle principali proprietà chimico-fisiche e di ADME
- PyMol - Obiettivi Agenda 2030 per lo sviluppo sostenibile
- Il corso soddisfa alcuni obiettivi dell'Agenda 2030 per lo sviluppo sostenibile